Les raies manta aiment fréquenter le parc national de Komodo, mais vous pourriez ne pas être en mesure de passer beaucoup de temps avec elles car vous risquez de vous perdre dans une dérive rapide. Cela dit, il existe certains sites où vous pouvez utiliser un hameçon pour récif et admirer les requins-renards, le thon, la carangue, le coureur arc-en-ciel et le barracuda à la recherche d’un repas. Les rayons d'aigle sont également souvent vus dans le bleu. Autour des récifs sains et en pente, on trouve généralement de nombreuses anthias lyretail, angelfish et fish butterfly. Parmi les coraux, il y a quelques créatures intéressantes à trouver comme le poisson-grenouille et le nudibranch.
Au large de Maumere, les récifs ont une bonne couverture de coraux mous et de crinoïdes colorés. Outre les poissons de récif colorés, recherchez les anguilles à ruban, les murènes, les homards et les crabes. Les gorgones sont nombreux ici et vous en trouverez peut-être des hippocampes pygmées. Les sites de boue pourraient révéler des poissons-scorpions d'Ambon, des crevettes, des seiches flamboyantes, des nudibranches colorés, des poulpes et d'autres créatures étranges.
