De uitstekende rifsystemen trekken duikers van over de hele wereld aan, en de eilanden zijn een ware bijenkorf van duikactiviteiten geworden.
De eilanden Roatan en Utila maken deel uit van het op een na grootste barrièrerif ter wereld, het Meso-Amerikaanse Barrièrerif. Vooral de eilanden Roatan en Utila bevatten levendig koraal, veelkleurige tropische vissen, sponzen zo groot als koelkasten en pelagische soorten. Misschien zie je mantaroggen, zeeschildpadden en, vooral van half februari tot april, walvishaaien. De riffen zijn hier diverser dan regenwouden.
Het eiland Roatan is een bedevaartsoord voor duikers die Centraal-Amerika bezoeken. Mary's Place staat algemeen bekend als een favoriete duikstek van het gebied, met smalle canyons en een overvloed aan wilde dieren. Zwart koraal en enorme wuivende zeewaaiers verstoppen zich in de eindeloze kloven.