L'isola di Malpelo è formata da roccia vulcanica e la sua superficie è ricoperta di licheni, muschi e alghe.
La scuola di squali martello smerlati è un punto culminante dell'isola di Malpelo, soprattutto nel sito di immersione di La Nevara. A volte visti in banchi di 200 squali, possono anche essere uniti a banchi ancora più grandi di squali seta. Vengono nelle stazioni di pulizia per nutrirsi, quindi aspettati di vedere anche molti pesci farfalla. Queste stazioni di pulizia e le acque ricche di sostanze nutritive attirano anche giganti gentili come le mante oceaniche e gli squali balena.
Gli avvistamenti di squali balena sono frequenti verso il nord dell'isola di Malpelo. I siti di immersione intorno all'isola presentano pareti per lo più ripide e pinnacoli mentre l'isola si alza da una cresta sottomarina. Ci sono anche caverne e alcuni fondali sabbiosi da esplorare.
La temperatura dell'acqua è solitamente calda a 26-28 ° C (79-82 ° F) ma all'inizio dell'anno può diventare fredda con una gamma di 16-25 ° C (61-77 ° F). Il rigurgito oceanico freddo causato da forti venti porta più plancton in superficie.
Il plancton può ridurre la visibilità a 33 piedi (10 m) dai soliti 100 piedi (30 m), ma ne vale la pena data l'abbondante vita marina intorno all'isola.
Vola all'aeroporto Gerardo Tobar López di Buenaventura, Colombia o, in alternativa, vola a Cali (codice aeroporto CLO) e cerca di arrivare almeno un giorno prima dell'inizio del viaggio. I trasferimenti da Cali a Buenaventura e di ritorno a Cali potrebbero essere inclusi nelle tariffe dell'hotel. Cali è collegata a livello internazionale con Miami (American Airlines e AVIANCA), New York JFK, Madrid (entrambe AVIANCA) e Panama-Tocumen (Copa Airlines).
Ci sono anche voli diretti per Cali da Quito, Guayaquil e Lima. È anche possibile volare a Cali via Bogotà che è collegata a varie città del Nord America (Atlanta, Boston, Dallas, Fort Lauderdale, Houston, Los Angeles, Miami, Newark, New York JFK, Orlando, Toronto, Washington) ed Europa (Amsterdam, Barcellona, Francoforte, Istanbul, Londra, Madrid, Monaco, Parigi).