L'ambiente sottomarino della zona è costituito da barriere coralline calcaree poco profonde, oltre 300 montagne sottomarine e pinnacoli, e un'enorme fossa sottomarina. Si vocifera anche di aerei e relitti, ma nessuno di questi è stato ancora descritto.
La maggior parte delle isole comprende una piattaforma poco profonda o una laguna che si perde nel blu. Dei siti descritti intorno a Diego Garcia, la maggior parte si trova a circa 30 metri di profondità massima. Dalla maggior parte delle località sono possibili immersioni sia dalla barca che dalla riva.
Sebbene non si sappia molto sulle immersioni nel Territorio britannico dell'Oceano Indiano, coloro che hanno avuto la possibilità di immergersi in queste acque spettacolari spesso affermano che si tratta delle acque più limpide e diversificate che abbiano mai visto.
I subacquei della zona possono aspettarsi condizioni incontaminate. Le temperature dell'acqua sono calde tutto l'anno e consentono di immergersi senza muta.
Da dicembre a febbraio è considerata la stagione delle piogge con venti da ovest-nord-ovest, mentre da giugno a settembre è la stagione secca con brezze da sud-est. I venti sono deboli tutto l'anno.