潜水员通常会在科莫多国家公园（Komodo National Park）上划一条直线，可从纳闽巴霍（Labuan Bajo）镇进入。在毛姆雷（Maumere）周围潜水包括到诸如礁岛，围墙和巨石之类的巴比岛，阿多纳拉岛或兰巴塔岛之类的岛屿旅行。目前还有大量的下水道，当然还有海湾周围的好运。
在这里潜水的最佳时间是从4月开始一直持续到12月的旱季。与科莫多类似，由于海流和波涛汹涌的地面条件，该地区需要一定的潜水经验。仅在Maumere，能见度平均约为50英尺（15m），而在Komodo，能见度可能超过100ft（30m）。
潜水科莫多国家公园是一件令人兴奋的事，但确实需要一点潜水经验，因为该地区以其迅捷而强大的水流而闻名。这里的水温范围为73-82°F（23-28°C），而较低的温度主要在南部。
潜水科莫多国家公园的最佳方法是在船上潜水，并且最佳潜水季节是在4月至8月的干燥月份。就是说，一些船上的船全年在这里航行。
前往弗洛雷斯岛潜水点通常需要从巴厘岛飞往毛梅雷或恩德等地区机场。从这些枢纽机场出发，潜水度假村和中心会安排船潜前往附近的珊瑚礁和海洋公园。弗洛雷斯岛也是前往科莫多国家公园的船宿潜水和潜水之旅的出发点。当地运营商提供潜水向导、设备租赁和培训课程。随着基础设施的不断完善和偏远潜水点的开放，弗洛雷斯岛的潜水之旅已成为探索印尼东部的冒险旅行者的理想之选。
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