La plongée en bateau de croisière en Équateur se concentre presque entièrement sur les îles Galapagos. Vous y trouverez des espèces fauniques parmi les plus diverses au monde, y compris un certain nombre d'espèces endémiques. Les îles Darwin et Wolf, dans le nord du pays, sont généralement considérées comme les meilleurs sites de plongée et ne sont accessibles que par bateau. Autour de ces îles, vous trouverez des requins baleines, des raies manta, des manchots et bien plus encore. Parce que les courants rendent la plongée difficile, un niveau intermédiaire est recommandé. Toute la zone est une zone de protection marine et seuls quelques bateaux de plongée sont autorisés à visiter les sites isolés. En raison du nombre de sites de plongée à visiter, la plupart des croisières durent entre 7 et 10 jours, et le meilleur moment pour plonger aux Galapagos est de juin à novembre.