Le meilleur moment pour plonger à Komodo est d'avril à août.Ce sont les meilleurs mois seulement parce que la plupart des liveaboards existent dans la région à ce moment. Sinon, la plongée à Komodo est géniale toute l'année. Avril à novembre est considéré comme la saison sèche. Avril, le mois qui suit la saison des pluies, connaît la meilleure action pélagique et les meilleures conditions sous-marines.En moyenne, la température de l’eau est plus fraîche, atteignant seulement 20 à 25 ° C (68 à 77 ° F) au sud et 25 à 28 ° C (77 à 82 ° F) au nord. En outre, juillet et août ont les températures de la mer les plus froides et les eaux les plus riches en nutriments. La visibilité à Komodo peut varier considérablement. Les sites plus proches des principales îles et de Labuan Bajo à Flores ont généralement une visibilité d'environ 15 mètres, tandis que les sites isolés accessibles uniquement par bateau peuvent se vanter d'une visibilité de 30 mètres ou plus.Enfin, les conditions de surface peuvent également changer de manière spectaculaire en fonction du mois ou de la situation géographique. Les sites de plongée du nord peuvent présenter des conditions de surface difficiles de janvier à mars, tandis que les sites de plongée du sud sont victimes de conditions de surface difficiles de juillet à août.
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